渡劫失败的修仙界大能，被困在都市平凡高中生体内，为了重回巅峰，他决定从“炼体”开始卷起。
接第一季结尾，仙帝牧云渡第九重天劫失败，灵魂附身到废柴高中生林木身上。他发现地球灵气稀薄，必须用“科学修仙法”——结合健身、饮食和电磁场来淬体。第二季中，牧云不仅要应付校园生活，对抗暗中觊觎他的魔道组织“暗月”，还要参加“全国高中生武道大会”。他的死对头是同样隐藏在都市中的魔尊转世。牧云通过发明“灵力健身环”和“奔跑吧修仙”APP，秘密培养了一批都市散修。本季高潮是武道大会决赛，牧云对战魔尊，双方肉身强度达到“十万层”境界，一拳打碎了体育馆的次元壁，导致真实与虚幻融合，为第三季埋下伏笔。
制作水准比第一季提升明显，打斗场面更加流畅，分镜极具冲击力。最大的亮点是把修仙体系和现代职场、校园文化结合，产生了奇妙的喜剧化学反应。男主一本正经地装逼，完全不尴尬。
每当爱人凝视我超过三十秒，时间就会重置，而他的记忆也会被彻底清除。
一只看不见的“黑手”把旧城里的三股势力全部拽进局中，连最信任的人也在夜色里露出真面目。
维多利亚时代，一个单身女子买下一座农场独自经营，镇上的三个男人都想娶她，也都要毁了她。
当驾驶员用歌声代替武器，高达不再杀人，而是让敌人哭着投降。
毕业十年后，一场同学聚会揭开了一本匿名写就的“大学生情史”，搅动了所有人的回忆。
十岁的天才妹妹发明了“读心仪”，却用来帮十二岁的哥哥追校花，引发一连串灾难。